在富兰克林于1785年决定返回费城后，他们的友谊一直延续着。他离开欧特伊的决定，尤其艰难，正如卡巴尼斯所说，双方都流下了许多光荣的眼泪。

富兰克林把他的一些私人物品作为纪念品送给了他的各种朋友。除了您看到这把配剑之外，卡巴尼斯还收到了富兰克林用来进行油水实验的空心手杖。”

他把资料递给琼斯，等其看完，又拿出了一本旧书，翻开其中一页，展示给琼斯，说道：“这是卡巴尼斯自己的记录，并在他死后，于1825年作为其全部作品的一部分出版。

1790年，富兰克林去世后，卡巴尼斯写了一篇详细而广泛的传记《本杰明·富兰克林传》，其中他忠实地记录并赞美了富兰克林的许多成就。

此时，卡巴尼斯获得了越来越多的认可，像富兰克林一样，他的职业生涯涵盖了政治和科学。作为一名内科医生和生理学家，他出版了一部很受欢迎的关于医院管理的专著，在巴厘医学院担任卫生学教授。

从1789年到1791年，他是高卢国大歌名早期广受欢迎的立宪派领袖米拉波的私人医生。

卡巴尼斯最初是歌名的热情支持者，也是五百人议会和后来的参议院的成员，但在紧张危险的统治时期，他拒绝被任命为驻米国代表，宁愿留在高卢国，以帮助和保护他的朋友。

在拿破仑统治时期，专心于学术生涯。他的主要著作是对生理学和心理学之间联系的开创性研究，卡巴尼斯被广泛认为是现代神经学的主要先驱。1796年，卡巴尼斯与夏洛特·菲利西蒂·德·格鲁希结婚。有一段时间，这对夫妇和他们的两个女儿住在欧特伊庄园。卡巴尼斯在1808年突然去世后，被安葬在巴厘的万神殿里，这是一座安葬高卢国最杰出的公民的教堂，拿破仑在他死后授予他帝国伯爵的头衔。

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